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Lien peptidique

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Le terme lien Il a plusieurs utilisations: dans ce cas, nous souhaitons parler de sa signification en tant qu’union ou lien entre différents éléments. Peptide , en revanche, est-ce lié à peptides : les molécules formées par un liaison covalente d'acides aminés (substances organiques dont la composition moléculaire comprend un groupe carboxyle et un groupe amino).

Il s'appelle liaison peptidique à liaison chimique qui est établi entre le groupe carboxyle d'un acide aminé et le groupe amino d'un autre acide aminé . Ce genre de lien où une molécule d'eau est perdue , permet la formation de ceux mentionnés peptides et du protéine .

En rejoignant un groupe amino (-NH2 ) et un groupe carboxyle (-COOH ) avec perte d'une molécule d'eau, un lien est établi CO-NH . Le développement de ce lien a toujours besoin de la contribution de énergie ; à son tour, lorsque la liaison peptidique est rompue, une libération d'énergie se produit.

La rupture d'un lien peptidique peut se produire par le biais l'hydrolyse : c'est le nom de la scission qui enregistre une molécule dans l'eau. L'hydrolyse, dans le milieu naturel, se fait très lentement, bien qu'il soit possible d'accélérer le processus en utilisant divers techniques .

En présence d'eau, une liaison peptidique peut être rompue avec une quantité d'énergie libre d'environ 8-16 kilojoules / mol (ce qui équivaut à 2-4 kcal / mol). L'unité kilojoules par mole , qui peut être symbolisé par kJ / mol , est reconnu par le Système international d'unités (OUI ) et correspond à la relation entre l'énergie et la quantité de la matière : l'énergie est exprimée en kilojoules et la matière est mesurée en moles.

Les kilojoules sont juste des milliers de joules, une autre unité de mesure reconnue par le système international, dont le nom original est joule et il est utilisé pour mesurer la chaleur, le travail et l’énergie. En termes techniques, sa définition est "la quantité de travail effectuée par un Newton avec une force constante le long d'un mètre dans la direction de cette force". L'unité mol d'autre part, est utilisé pour mesurer la quantité d'une substance donnée et fait partie de la sept quantités physiques fondamentales du SI.

Pour accélérer l'hydrolyse d'une liaison peptidique, ce qui dans la nature peut prendre plus d'un millénaire, les scientifiques peuvent choisir l'une des options suivantes: les méthodes :

* hydrolyse acide Il est obtenu en laissant la protéine à ébullition pendant une longue période avec des solutions de type acide fort (H2SO4 et HCl). Ce chemin permet la destruction complète du tryptophane et d'une partie de la thréonine et de la sérine;

* hydrolyse basique : il est généralement effectué avec du BaOH ou du NaOH et ne détruit pas acides aminés mentionné dans la méthode précédente;

* hydrolyse enzymatique : chez les êtres vivants, cette façon de dégrader les liaisons peptidiques est la plus normale. Dans ce cas, certains des enzymes les protéolytiques qui agissent lentement et souvent ne terminent pas leur travail, bien que ni la destruction des acides aminés ni la racémisation ne se produisent (lorsqu'un composé optiquement actif devient racémique). Ce type d'hydrolyse est très spécifique;

* hydrolyse en température : si les conditions sont normales, les liaisons peptidiques ne sont pas détruites, mais la protéine peut être dénaturée (c'est-à-dire que sa des structures secondaire, tertiaire et quaternaire). Par contre, si une température supérieure à 110 ° C est appliquée pendant 48 heures, il est possible de détruire les liens.

Il convient de noter que, en général, la liaison peptidique est représentée sous forme de lien unique . Quoi qu'il en soit, il possède plusieurs fonctionnalités qui le rapprochent d'un double lien. C'est pourquoi les spécialistes mentionnent souvent qu'un lien peptidique présente propriétés cela le place à mi-chemin entre un lien simple et un lien double.

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